基因芯片實驗外包
基因芯片的測序原理是雜交測序方法，即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法，在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。

基因芯片實驗外包原理

　　利用雜交的原理，即DNA根據(jù)堿基配對原則，在常溫下和中性條件下形成雙鏈DNA分子，但在高溫、堿性或有機溶劑等條件下，雙螺旋之間的氫鍵斷裂，雙螺旋解開，形成單鏈分子(稱為DNA變性，DNA變性時的溫度稱Tm值)。變性的DNA黏度下降，沉降速度增加，浮力上升，紫外吸收增加。當(dāng)消除變性條件后，變性DNA兩條互補鏈可以重新結(jié)合，恢復(fù)原來的雙螺旋結(jié)構(gòu)，這一過程稱為復(fù)性。復(fù)性后的DNA，其理化性質(zhì)能得到恢復(fù)。

利用DNA這一重要理化特性，將兩個以上不同來源的多核苷酸鏈之間由于互補性而使它們在復(fù)性過程中形成異源雜合分子的過程稱為雜交(hydridization)。雜交體中的分子不是來自同一個二聚體分子。由于溫度比其他變性方法更容易控制，當(dāng)雙鏈的核酸在高于其變性溫度(Tm值)時，解螺旋成單鏈分子;當(dāng)溫度降到低于Tm值時，單鏈分子根據(jù)堿基的配對原則再度復(fù)性成雙鏈分子。因此通常利用溫度的變化使DNA在變性和復(fù)性的過程中進行核酸雜交。

基因芯片實驗外包數(shù)據(jù)分析（以miRNA芯片分析為例）

標(biāo)準(zhǔn)分析

芯片預(yù)處理與標(biāo)準(zhǔn)化；

篩選差異表達(dá)microRNA；

microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等；

microRNA靶基因預(yù)測，基于多數(shù)據(jù)庫整合的靶基因預(yù)測以及上海豐核自主知識產(chǎn)權(quán)的預(yù)測軟件同時識別；

對預(yù)測的microRNA的靶基因進行GO富集分析通路富集分析等。

個性化分析

1.microRNA網(wǎng)絡(luò)分析：microRNA靶基因失調(diào)網(wǎng)絡(luò)；microNRA功能協(xié)同作用網(wǎng)絡(luò)。

2.microRNA與其他芯片整合分析：與lncRNAs芯片結(jié)果聯(lián)合分析（ceRNA Analysis）；與mRNA芯片整合分析；與DNA甲基化芯片結(jié)果聯(lián)合分析。

3.與臨床數(shù)據(jù)整合分析

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